Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCO2Q9BYV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCO2Q9BYV7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCO2Q9BYV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms