Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP1-5Q9BYS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-5Q9BYS1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-5Q9BYS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP1-5Q9BYS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KRTAP1-5Q9BYS1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KRTAP1-5Q9BYS1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms