Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FNDC11Q9BVV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC11Q9BVV2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC11Q9BVV2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC11Q9BVV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms