Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF4Q9BUZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF4Q9BUZ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAF4Q9BUZ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms