Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RBM42Q9BTD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RBM42Q9BTD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RBM42Q9BTD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RBM42Q9BTD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
RBM42Q9BTD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms