Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP6Q9BRS8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP6Q9BRS8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LARP6Q9BRS8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LARP6Q9BRS8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LARP6Q9BRS8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms