Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MESP1Q9BRJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MESP1Q9BRJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MESP1Q9BRJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MESP1Q9BRJ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms