Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
FYCO1Q9BQS8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
FYCO1Q9BQS8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
FYCO1Q9BQS8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
FYCO1Q9BQS8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
FYCO1Q9BQS8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
FYCO1Q9BQS8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms