Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUP88Q99567 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP88Q99567 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP88Q99567 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP88Q99567 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP88Q99567 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms