Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMNAT3Q96T66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMNAT3Q96T66 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMNAT3Q96T66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NMNAT3Q96T66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NMNAT3Q96T66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NMNAT3Q96T66 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NMNAT3Q96T66 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NMNAT3Q96T66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms