Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS6KC1Q96S38 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS6KC1Q96S38 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPS6KC1Q96S38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPS6KC1Q96S38 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPS6KC1Q96S38 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms