Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC45A3Q96JT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC45A3Q96JT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC45A3Q96JT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC45A3Q96JT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms