Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM41AQ96HV5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM41AQ96HV5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM41AQ96HV5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM41AQ96HV5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms