Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX27Q96GQ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX27Q96GQ7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX27Q96GQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX27Q96GQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX27Q96GQ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms