Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC35A4Q96G79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC35A4Q96G79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35A4Q96G79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35A4Q96G79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms