Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG4CQ96DT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG4CQ96DT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATG4CQ96DT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG4CQ96DT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG4CQ96DT6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms