Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PGBD4Q96DM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PGBD4Q96DM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PGBD4Q96DM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD4Q96DM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms