Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSPC1Q8WXF1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSPC1Q8WXF1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSPC1Q8WXF1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PSPC1Q8WXF1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSPC1Q8WXF1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms