Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF4Q8WWF5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNRF4Q8WWF5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF4Q8WWF5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF4Q8WWF5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNRF4Q8WWF5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF4Q8WWF5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF4Q8WWF5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF4Q8WWF5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF4Q8WWF5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms