Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf54Q8WWF1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf54Q8WWF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf54Q8WWF1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf54Q8WWF1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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