Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX33Q8WV41 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX33Q8WV41 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX33Q8WV41 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX33Q8WV41 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms