Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MSL3Q8N5Y2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MSL3Q8N5Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MSL3Q8N5Y2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MSL3Q8N5Y2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MSL3Q8N5Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms