Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNTD2Q8IXW0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMNTD2Q8IXW0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LMNTD2Q8IXW0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms