Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFVQ71UI9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
H2AFVQ71UI9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFVQ71UI9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
H2AFVQ71UI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H2AFVQ71UI9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H2AFVQ71UI9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms