Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRIP3Q6Q6R5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms