Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3F3CQ6NXT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3F3CQ6NXT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3F3CQ6NXT2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms