Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CREB3L3Q68CJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CREB3L3Q68CJ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CREB3L3Q68CJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CREB3L3Q68CJ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms