Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO47Q5MNV8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO47Q5MNV8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO47Q5MNV8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO47Q5MNV8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO47Q5MNV8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms