Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPANXN4Q5MJ08 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPANXN4Q5MJ08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN4Q5MJ08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN4Q5MJ08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN4Q5MJ08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms