Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TDRD12Q587J7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TDRD12Q587J7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TDRD12Q587J7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TDRD12Q587J7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms