Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NBPF8Q3BBV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NBPF8Q3BBV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NBPF8Q3BBV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NBPF8Q3BBV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NBPF8Q3BBV2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms