Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.05■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.02■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
FHOD3Q2V2M9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
FHOD3Q2V2M9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
FHOD3Q2V2M9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
FHOD3Q2V2M9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
FHOD3Q2V2M9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.71■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
FHOD3Q2V2M9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
FHOD3Q2V2M9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
FHOD3Q2V2M9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms