Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KARSQ15046 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KARSQ15046 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KARSQ15046 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KARSQ15046 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KARSQ15046 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KARSQ15046 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KARSQ15046 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KARSQ15046 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KARSQ15046 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KARSQ15046 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KARSQ15046 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KARSQ15046 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KARSQ15046 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KARSQ15046 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KARSQ15046 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KARSQ15046 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KARSQ15046 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KARSQ15046 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KARSQ15046 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KARSQ15046 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KARSQ15046 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KARSQ15046 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KARSQ15046 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KARSQ15046 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KARSQ15046 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KARSQ15046 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KARSQ15046 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KARSQ15046 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KARSQ15046 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KARSQ15046 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KARSQ15046 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KARSQ15046 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KARSQ15046 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KARSQ15046 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KARSQ15046 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KARSQ15046 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KARSQ15046 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KARSQ15046 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KARSQ15046 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KARSQ15046 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KARSQ15046 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KARSQ15046 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KARSQ15046 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KARSQ15046 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KARSQ15046 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KARSQ15046 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KARSQ15046 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KARSQ15046 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KARSQ15046 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KARSQ15046 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KARSQ15046 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KARSQ15046 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KARSQ15046 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KARSQ15046 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KARSQ15046 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KARSQ15046 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KARSQ15046 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KARSQ15046 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KARSQ15046 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KARSQ15046 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KARSQ15046 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KARSQ15046 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KARSQ15046 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KARSQ15046 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KARSQ15046 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KARSQ15046 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KARSQ15046 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KARSQ15046 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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