Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA4Q14CN2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCA4Q14CN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCA4Q14CN2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCA4Q14CN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms