Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1D2Q14995 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1D2Q14995 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1D2Q14995 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR1D2Q14995 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR1D2Q14995 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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