Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNW1Q13573 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SNW1Q13573 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SNW1Q13573 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNW1Q13573 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNW1Q13573 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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