Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACVR1Q04771 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACVR1Q04771 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACVR1Q04771 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACVR1Q04771 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACVR1Q04771 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1Q04771 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1Q04771 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1Q04771 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1Q04771 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1Q04771 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1Q04771 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1Q04771 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms