Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT17Q04695 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT17Q04695 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT17Q04695 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT17Q04695 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms