Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CFHR1Q03591 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFHR1Q03591 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFHR1Q03591 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFHR1Q03591 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFHR1Q03591 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms