Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC42EP1Q00587 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC42EP1Q00587 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC42EP1Q00587 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC42EP1Q00587 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms