Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS18P62269 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS18P62269 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS18P62269 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS18P62269 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS18P62269 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS18P62269 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS18P62269 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS18P62269 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS18P62269 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS18P62269 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS18P62269 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS18P62269 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS18P62269 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS18P62269 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS18P62269 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS18P62269 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS18P62269 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS18P62269 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS18P62269 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS18P62269 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS18P62269 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS18P62269 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS18P62269 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS18P62269 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS18P62269 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS18P62269 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS18P62269 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPS18P62269 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS18P62269 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS18P62269 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS18P62269 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS18P62269 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS18P62269 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS18P62269 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS18P62269 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS18P62269 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS18P62269 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS18P62269 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS18P62269 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS18P62269 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS18P62269 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS18P62269 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS18P62269 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS18P62269 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS18P62269 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS18P62269 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS18P62269 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS18P62269 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS18P62269 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS18P62269 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS18P62269 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS18P62269 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS18P62269 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS18P62269 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS18P62269 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS18P62269 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS18P62269 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS18P62269 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS18P62269 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS18P62269 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS18P62269 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS18P62269 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS18P62269 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS18P62269 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS18P62269 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS18P62269 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS18P62269 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS18P62269 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS18P62269 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS18P62269 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms