Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00205P59089 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00205P59089 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00205P59089 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00205P59089 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms