Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VCPP55072 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VCPP55072 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VCPP55072 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCPP55072 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCPP55072 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCPP55072 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VCPP55072 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPP55072 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPP55072 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPP55072 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPP55072 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VCPP55072 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VCPP55072 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPP55072 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPP55072 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPP55072 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPP55072 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPP55072 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VCPP55072 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPP55072 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPP55072 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VCPP55072 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPP55072 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPP55072 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VCPP55072 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPP55072 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPP55072 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VCPP55072 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCPP55072 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCPP55072 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VCPP55072 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VCPP55072 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPP55072 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPP55072 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPP55072 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPP55072 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VCPP55072 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VCPP55072 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPP55072 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPP55072 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPP55072 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPP55072 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPP55072 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VCPP55072 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPP55072 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPP55072 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPP55072 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VCPP55072 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VCPP55072 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPP55072 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPP55072 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPP55072 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPP55072 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPP55072 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VCPP55072 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPP55072 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPP55072 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VCPP55072 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VCPP55072 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VCPP55072 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VCPP55072 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPP55072 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPP55072 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPP55072 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPP55072 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPP55072 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VCPP55072 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPP55072 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPP55072 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPP55072 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPP55072 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPP55072 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VCPP55072 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VCPP55072 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms