Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ME1P48163 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ME1P48163 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ME1P48163 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ME1P48163 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ME1P48163 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ME1P48163 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME1P48163 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME1P48163 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ME1P48163 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME1P48163 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME1P48163 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ME1P48163 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ME1P48163 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ME1P48163 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ME1P48163 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ME1P48163 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ME1P48163 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ME1P48163 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ME1P48163 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ME1P48163 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME1P48163 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ME1P48163 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ME1P48163 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ME1P48163 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ME1P48163 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ME1P48163 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME1P48163 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ME1P48163 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME1P48163 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME1P48163 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME1P48163 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME1P48163 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME1P48163 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ME1P48163 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME1P48163 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME1P48163 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ME1P48163 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ME1P48163 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ME1P48163 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME1P48163 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ME1P48163 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ME1P48163 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ME1P48163 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ME1P48163 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME1P48163 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME1P48163 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME1P48163 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME1P48163 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME1P48163 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ME1P48163 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME1P48163 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME1P48163 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME1P48163 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ME1P48163 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME1P48163 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME1P48163 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME1P48163 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ME1P48163 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME1P48163 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME1P48163 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ME1P48163 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ME1P48163 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ME1P48163 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ME1P48163 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME1P48163 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME1P48163 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME1P48163 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME1P48163 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ME1P48163 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ME1P48163 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME1P48163 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ME1P48163 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME1P48163 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ME1P48163 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME1P48163 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME1P48163 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME1P48163 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME1P48163 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ME1P48163 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ME1P48163 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ME1P48163 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ME1P48163 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME1P48163 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME1P48163 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME1P48163 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ME1P48163 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ME1P48163 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ME1P48163 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ME1P48163 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ME1P48163 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ME1P48163 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME1P48163 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ME1P48163 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms