Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FLT4P35916 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FLT4P35916 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FLT4P35916 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FLT4P35916 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FLT4P35916 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FLT4P35916 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FLT4P35916 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FLT4P35916 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
FLT4P35916 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FLT4P35916 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FLT4P35916 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FLT4P35916 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
FLT4P35916 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FLT4P35916 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FLT4P35916 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FLT4P35916 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FLT4P35916 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
FLT4P35916 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
FLT4P35916 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FLT4P35916 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
FLT4P35916 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FLT4P35916 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FLT4P35916 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FLT4P35916 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FLT4P35916 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FLT4P35916 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FLT4P35916 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FLT4P35916 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
FLT4P35916 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
FLT4P35916 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
FLT4P35916 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLT4P35916 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FLT4P35916 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FLT4P35916 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
FLT4P35916 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FLT4P35916 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FLT4P35916 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FLT4P35916 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FLT4P35916 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FLT4P35916 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FLT4P35916 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FLT4P35916 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FLT4P35916 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FLT4P35916 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
FLT4P35916 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FLT4P35916 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FLT4P35916 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FLT4P35916 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FLT4P35916 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FLT4P35916 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FLT4P35916 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FLT4P35916 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
FLT4P35916 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLT4P35916 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLT4P35916 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLT4P35916 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLT4P35916 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLT4P35916 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLT4P35916 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
FLT4P35916 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FLT4P35916 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FLT4P35916 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
FLT4P35916 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
FLT4P35916 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLT4P35916 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLT4P35916 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLT4P35916 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLT4P35916 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLT4P35916 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLT4P35916 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FLT4P35916 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FLT4P35916 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FLT4P35916 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FLT4P35916 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FLT4P35916 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FLT4P35916 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FLT4P35916 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FLT4P35916 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FLT4P35916 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FLT4P35916 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FLT4P35916 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FLT4P35916 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FLT4P35916 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FLT4P35916 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FLT4P35916 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FLT4P35916 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms