Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX11P35716 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX11P35716 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX11P35716 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX11P35716 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX11P35716 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX11P35716 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX11P35716 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX11P35716 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX11P35716 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX11P35716 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX11P35716 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX11P35716 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX11P35716 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX11P35716 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX11P35716 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX11P35716 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX11P35716 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX11P35716 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX11P35716 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX11P35716 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX11P35716 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX11P35716 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX11P35716 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX11P35716 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX11P35716 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX11P35716 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX11P35716 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX11P35716 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX11P35716 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX11P35716 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX11P35716 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX11P35716 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX11P35716 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX11P35716 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX11P35716 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX11P35716 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX11P35716 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX11P35716 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX11P35716 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX11P35716 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX11P35716 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX11P35716 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX11P35716 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX11P35716 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX11P35716 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX11P35716 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX11P35716 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX11P35716 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX11P35716 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX11P35716 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX11P35716 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX11P35716 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX11P35716 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX11P35716 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX11P35716 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX11P35716 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX11P35716 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX11P35716 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX11P35716 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX11P35716 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX11P35716 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX11P35716 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX11P35716 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX11P35716 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX11P35716 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX11P35716 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX11P35716 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX11P35716 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOX11P35716 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX11P35716 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX11P35716 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX11P35716 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX11P35716 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX11P35716 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX11P35716 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX11P35716 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX11P35716 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX11P35716 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX11P35716 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX11P35716 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX11P35716 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX11P35716 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX11P35716 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX11P35716 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX11P35716 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX11P35716 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX11P35716 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX11P35716 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX11P35716 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX11P35716 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX11P35716 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX11P35716 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX11P35716 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms