Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD34P28906 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD34P28906 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD34P28906 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD34P28906 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD34P28906 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD34P28906 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD34P28906 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD34P28906 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD34P28906 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD34P28906 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD34P28906 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD34P28906 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD34P28906 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD34P28906 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD34P28906 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD34P28906 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD34P28906 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD34P28906 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD34P28906 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD34P28906 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD34P28906 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD34P28906 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD34P28906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD34P28906 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD34P28906 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD34P28906 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD34P28906 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD34P28906 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD34P28906 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD34P28906 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD34P28906 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD34P28906 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD34P28906 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD34P28906 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD34P28906 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD34P28906 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD34P28906 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD34P28906 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD34P28906 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD34P28906 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD34P28906 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD34P28906 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CD34P28906 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD34P28906 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD34P28906 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CD34P28906 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CD34P28906 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CD34P28906 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CD34P28906 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CD34P28906 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms