Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRR2P28476 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRR2P28476 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRR2P28476 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRR2P28476 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms