Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LOXP28300 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXP28300 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXP28300 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXP28300 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LOXP28300 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXP28300 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXP28300 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXP28300 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXP28300 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LOXP28300 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LOXP28300 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LOXP28300 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LOXP28300 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LOXP28300 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LOXP28300 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXP28300 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXP28300 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXP28300 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXP28300 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXP28300 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LOXP28300 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXP28300 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXP28300 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXP28300 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXP28300 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXP28300 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LOXP28300 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXP28300 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXP28300 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXP28300 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXP28300 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXP28300 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LOXP28300 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LOXP28300 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXP28300 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXP28300 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXP28300 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXP28300 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LOXP28300 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LOXP28300 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LOXP28300 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXP28300 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LOXP28300 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXP28300 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXP28300 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXP28300 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXP28300 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXP28300 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LOXP28300 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXP28300 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXP28300 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXP28300 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LOXP28300 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXP28300 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXP28300 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXP28300 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXP28300 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LOXP28300 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXP28300 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXP28300 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LOXP28300 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXP28300 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXP28300 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LOXP28300 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LOXP28300 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXP28300 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXP28300 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXP28300 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LOXP28300 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms