Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SSFA2P28290 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SSFA2P28290 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SSFA2P28290 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SSFA2P28290 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SSFA2P28290 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms